棉花作为全球重要的经济作物，其品质安全和遗传特性检测对产业链具有关键作用。定性PCR检测技术凭借其高灵敏度、快速性和特异性，已成为棉花基因鉴定、转基因成分筛查及病原检测的核心手段。该技术通过扩增目标DNA片段，可精准识别棉花品种特性、外源基因插入及病原微生物的存在，为种子质量管控、品种权保护及病虫害防控提供科学依据。在进出口贸易中，PCR检测更是应对技术性贸易壁垒的重要工具。
1. 转基因成分检测：筛查CaMV 35S启动子、NOS终止子等通用元件
2. 品种特异性检测：鉴定陆地棉、海岛棉等栽培种特征基因
3. 病原微生物检测：检测黄萎病菌（Verticillium dahliae）等特异性序列
4. 品质相关基因：验证纤维强度相关基因（如GhSus）的表达特性
• 核酸提取系统：磁珠法全自动核酸提取仪（如KingFisher Flex）
• PCR扩增仪：梯度PCR仪（如Bio-Rad T100）
• 电泳分析系统：琼脂糖凝胶电泳装置及成像系统
• 实时荧光PCR仪（qPCR）：用于高灵敏度检测（如Applied Biosystems 7500）
• 超微量分光光度计：核酸浓度与纯度测定（如NanoDrop系列）
1. DNA提取：采用CTAB法或试剂盒法提取棉花组织基因组DNA
2. 引物设计：依据NCBI数据库靶序列设计特异性引物（长度18-24bp）
3. PCR反应体系：25μL体系含Taq酶、dNTPs、缓冲液及模板DNA
4. 扩增程序：预变性（95℃ 5min）→35循环扩增（95℃ 30s→退火30s→72℃ 1min）→终延伸（72℃ 10min）
5. 结果判读：1.5%琼脂糖凝胶电泳（120V 30min），EB染色后观察特异性条带
• GB/T 19495.5-2018 转基因植物检测 核酸定量PCR检测方法
• SN/T 1196-2020 植物及其产品转基因成分实时荧光PCR检测方法
• ISO 21571:2005 食品检测-核酸提取纯化方法
• 国际种子检验协会（ISTA）分子检测指南
• 农业农村部《农业转基因生物检测规程》
1. 设置阳性/阴性对照：使用已知样本确保反应体系有效性
2. 防污染措施：实验区分区操作，使用UNG酶防扩增产物污染
3. 引物验证：通过BLAST比对确保特异性，测试退火温度梯度
4. 重复检测：关键样本需三次独立实验验证
5. 数据记录：完整保存电泳图像、扩增曲线等原始数据
